Im Regenwald von Nicaragua lassen sich zahlreiche Tiere finden, wie Affen, Faultiere, Ameisenbären, Frösche, Tukane, Kolibris oder Papageien, um nur einige zu nennen. Im Südosten des Landes liegt das größte Regenwaldgebiet Nicaraguas. Hier leben Affen, Jaguare, Schildkröten und natürlich unzählige Vogelarten wie überall im Regenwald.
Am südlichen Pazifikstrand, speziell an der Playa de Coco, kommen jährlich zwischen Juli und Januar zahlreiche Schildkröten zur Eiablage. Im tropischen Wald dieser Region gibt es auch viele Säugetiere, Reptilien und Insekten.
Die Mangroven an der Pazifik- und Karibikküste bieten mit ihren Kronen vielen Vögeln ein Zuhause. Hier findet man Tölpel, Fregattvögel, Fischadler, Pelikane und Reiher. Unter Wasser gibt es häufig Muscheln und Seepocken, aber auch Schnecken, Fische und Krebse. Auch Reptilien lassen sich gut in Mangroven beobachten, z.B. auch auf Big Corn Island.
Im Nebelwald von Nicaragua lässt sich mit viel Glück auch der Quetzal, der Göttervogel der Maya, finden. Aber auch Brüllaffen, Ozelot und Flussotter nennen dieses Gebiet ihr Zuhause.
